Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC8Q9Y2L5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RAMP3-201ENST00000242249 1323 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC8Q9Y2L5 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms