Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MIR3677-201ENST00000578964 60 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZNRF3Q9ULT6 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms