Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 SLC6A5-202ENST00000525748 7084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
TRAPPC2LQ9UL33 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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