Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CTNNAL1Q9UBT7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms