Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLKQ9UBT6 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms