Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RRBP1Q9P2E9 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.5 ms