Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
USP36Q9P275 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms