Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z2

CALCOCO1, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO1Q9P1Z2 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CALCOCO1Q9P1Z2 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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