Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HACD3Q9P035 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
HACD3Q9P035 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms