Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CYLDQ9NQC7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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