Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ZCCHC17Q9NP64 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms