Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC091564.6-201ENST00000526633 487 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC138466.5-201ENST00000624002 808 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
C11orf49Q9H6J7 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms