Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CEP44Q9C0F1 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms