Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LRRC3Q9BY71 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms