Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC4A1-201ENST00000262418 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 SNX33-201ENST00000308527 8008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TRIB2-201ENST00000155926 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
HIGD2AQ9BW72 APPBP2-201ENST00000083182 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms