Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUF5

TUBB6, Tubulin beta-6 chain, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB6Q9BUF5 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TUBB6Q9BUF5 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TUBB6Q9BUF5 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms