Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2AFJQ9BTM1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms