Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMAD5Q99717 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms