Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
RBBP8Q99708 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms