Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CDK5RAP3Q96JB5 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms