Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
RUNDC1Q96C34 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
RUNDC1Q96C34 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms