Protein–RNA interactions for Protein: Q96B86

RGMA, Repulsive guidance molecule A, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMAQ96B86 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RGMAQ96B86 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms