Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GTF3C6Q969F1 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms