Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ19

KCTD13, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD13Q8WZ19 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCTD13Q8WZ19 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms