Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATAD1Q8NBU5 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms