Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF6

AVL9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AVL9Q8NBF6 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
AVL9Q8NBF6 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms