Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
TTC29Q8NA56 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms