Protein–RNA interactions for Protein: Q86V81

ALYREF, THO complex subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREFQ86V81 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALYREFQ86V81 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALYREFQ86V81 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms