Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TMEM47-201ENST00000275954 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HDXQ7Z353 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms