Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHLHA9Q7RTU4 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BHLHA9Q7RTU4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms