Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CCDC80Q76M96 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CCDC80Q76M96 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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