Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CCDC149Q6ZUS6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms