Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TMC5Q6UXY8 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms