Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 GRIN1-203ENST00000371550 3940 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CCBE1Q6UXH8 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CCBE1Q6UXH8 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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