Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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C9orf135Q5VTT2 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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C9orf135Q5VTT2 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
C9orf135Q5VTT2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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