Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 GDPGP1-202ENST00000558017 5323 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 KCNIP1-208ENST00000520740 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ELN-209ENST00000380576 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ALPP-201ENST00000392027 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 GRM1-204ENST00000492807 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 PSMC1-201ENST00000261303 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
LINC01545Q5VT33 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms