Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ08

SPANXN4, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N4, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SPANXN4Q5MJ08 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SPANXN4Q5MJ08 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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