Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SLC27A3Q5K4L6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.3 ms