Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ALFQ53S48 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ALFQ53S48 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms