Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC96Q2M329 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms