Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
MSMPQ1L6U9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms