Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC142Q17RM4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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