Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
IMPG1Q17R60 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
IMPG1Q17R60 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms