Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC010900.1-201ENST00000449849 1296 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC092073.1-202ENST00000606020 653 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 RPP40-203ENST00000464646 1042 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AP005899.1-201ENST00000579467 544 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LAMA3Q16787 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMA3Q16787 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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LAMA3Q16787 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LAMA3Q16787 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LAMA3Q16787 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LAMA3Q16787 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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LAMA3Q16787 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAMA3Q16787 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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