Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK5Q16478 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GRIK5Q16478 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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