Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNGA3Q16281 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
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