Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GRIK4Q16099 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms