Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ANAPC11-221ENST00000584314 559 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
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VPS72Q15906 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PAQR9-AS1-203ENST00000497652 516 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
VPS72Q15906 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
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