Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CDSNQ15517 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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