Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AL451000.1-201ENST00000451300 1186 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 GLUD1P3-201ENST00000507952 896 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
R3HDM1Q15032 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 AC008972.2-201ENST00000606587 494 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 PHF23-213ENST00000613632 850 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
R3HDM1Q15032 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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